讲座题目： Engineering mammalian gene circuits for dissection and perturbation of biological networks

主讲人💟： 谢震 清华信息国家实验室生物信息学研究部/合成与系统生物学研究中心研究员

主持人：叶海峰 研究员

开始时间：2015-04-02 10:30

讲座地址🌯：闵行生科院534报告厅

主办单位：天美娱乐 科技处

报告人简介👩‍🎤：

谢震🤦，现任清华信息国家实验室生物信息学研究部/合成与系统生物学研究中心研究员🏂🏻。1998年、2001年于山东农业大学取得本科和硕士学位🙌🏻。2006年获美国内华达大学拉斯维加斯分校生物学博士🫚。分别于2006年至2010年在哈佛大学系统生物学中心，2010年至2011年在麻省理工天美生物工程系🥐、计算机与人工智能实验室从事博士后研究。2012年1月 起任职清华大学研究员。研究主要致力于建立合成生物学使能技术平台，利用合成基因元件和基因线路研究转录、后转录调控网络的设计原理和基因相互作用网络的 调控机制，构建以非破坏性方式监控细胞状态变化的合成生物系统，从而帮助解决生物基础研究和生物医药应用领域中的关键问题。在包括Science⛸、Nature子刊、PNAS💆🏽、NAR等国际著名杂志发表SCI论文19篇🤌🏼，以第一作者或者通讯作者身份发表9篇研究论文和2篇书籍章节，WOS总他引595次，单篇最高他引149次。

报告摘要🤞🏻：

Synthetic gene circuits are designed to implement desired cellular functions in living cells through sensing, integration and processing of molecular information, which will have profound implications in basic biological research and biomedical applications. In the first part of my talk, I will introduce our recent progress on modular construction of gene circuit using TALE repressors. I will show that using the input-output transfer curves of individual TALERs enables accurate prediction of the behavior of modularly assembled TALER cascade and switch circuits. Then, I will present that TALER switches employing feedback regulation exhibit improved accuracy for microRNA-based cancer cell classification. In the second part of my talk, I will show our results of model-guided quantitative analysis of microRNA-mediated regulations on competing RNAs by using a synthetic gene circuit. Our computational and experimental results reveal that the relative abundance of miRNAs and competing RNAs, the binding free energies and the number of miRNA regulatory elements (MREs) have strong impacts on miRNA-mediated regulations on competing RNAs.